Den grössten Erfolg der Klubgeschichte hat Rapperswil- Jona mit der Qualifikation für die Aufstiegsspiele zur Challenge League geschafft. Den St. Gallern reichte dazu ein 1:1 beim direkten Rivalen SV Schaffhausen. Den entscheidenden Treffer vor 800 Zuschauern erzielte für Rapperswil-Jona der ehemalige FCZ-Junior Leo Rapisarda per Kopf.